Село Парфеново упоминается в архивных документах, начиная с XVII века. В 1628 году здесь уже стоял деревянный храм в честь Богоявления Господня.
Существующую каменную церковь с колокольней построили в 1813 году на средства местного помещика Петра Астафьева. В 1830 году над могилой храмосоздателя (с северной стороны) был построен придел во имя святителя Петра, Митрополита Московского. Третий придел в честь Тихвинской иконы Божией Матери устроили на южной стороне трапезной части. В XIX веке село входило в состав Переяславского уезда Владимирской губернии.
Церковь закрыли в 1926 году. Последними настоятелями были иерей Сергий и иерей Александр. Диакон Иоанн был убит, по рассказам старожилов, со всей своей семьей. В советское время обрушился купол со шпилем на колокольне, утрачена кровля, разрушено перекрытие придела…
Храм — один из интересных памятников позднего классицизма Сергиево-Посадского района, одновременно сохраняющий архаичные приемы перекрытия сводов. Свод восьмерика расписан под небо, под окнами — три евангелиста (четвертый изображен не был), на восточной стене — образ «Христос во славе». На западной стене четверика — изображения «Введение во храм Пресвятой Богородицы» и «Крещение Господне». На западной стене придела — «Погребение Митрополита Петра».
Началась реставрация. 9 июля 2003 года, в день празднования Тихвинской иконы Божией Матери, была совершена первая после закрытия храма Божественная литургия.
